Der ehemalige Weinkeller in der unteren Altstadt wurde 1980 von den beiden Puppenspielern Rolf Meyer und Martin Friedli zu einem Theaterraum umgestaltet, in dem vor allem ihre eigenen Stücke zur Aufführung gelangten. Zusammen mit Radek Barosch spielten sie über Jahre erfolgreich und machten das Berner Puppen Theater zu einer bekannten Spielstätte für das Figurentheater.
1992 übernahm die 1968 gegründete Puppenbühne Demenga/Wirth das Theater.
Im Berner Puppen Theater besitzt Bern einen einzigartigen Ort, wo Figurentheater in seiner ganzen lebendigen Vielfalt gezeigt wird: Theater mit Marionetten, Stabpuppen, Handfiguren, Schattenfiguren, Objekten und Masken.
Gespielt wird sowohl für Kinder als auch für Erwachsene. Der Hauptteil der Veranstaltungen wird von der Puppenbühne Demenga/Wirth bestritten, ergänzt durch ausgewählte Gastspiele nationaler und internationaler Gruppen.
Ausserdem ist das Berner Puppen Theater auch ein Forum für andere Sparten: Lesungen, Musik für Kinder, Märchenerzähler usw. Zudem erhalten die Veranstaltungsreihen "Altstadtpodium" und "Die Welt erzählt" regelmässig Gastrecht im Theater.

Ergänzt werden diese öffentlichen Vorstellungen durch zahlreiche geschlossene Anlässe für Schulen und Private. Die Spielzeit dauert in der Regel von Mitte Oktober bis Ende April.